一、細胞或組織破碎
1. 微生物材料
(1)發(fā)酵3~4天(或對數(shù)生長期)的菌體,離心收集菌絲體(動植物材料無需此步處理)。
(2)用經(jīng)DEPC處理的水洗菌絲體2~3次,并盡量除去殘存的水。
(3)加液氮充分研磨,使其成為粉末,以釋放RNA。
(4)研磨后的樣品轉移至12 ml 變性液的容器中勻漿。
2. 動植物細胞培養(yǎng)材料 (適用的樣品量為細胞:108)
(1)細胞或組織培養(yǎng):按常規(guī)方法進行。
(2)深層懸浮培養(yǎng)細胞的破碎。
①細胞收集:含一定濃度的細胞培養(yǎng)液置于無菌離心管中,4℃,3 000 g 離心5分鐘。
②細胞洗滌:上步沉淀用25 ml 滅菌后冰凍的1xPBS緩沖液洗滌,然后4℃,3 000 g 離心5分鐘。
③細胞破碎:在沉淀細胞中加入15 ml 預冷的變性液,用無菌處理過的勻漿器勻漿。
3. 表面培養(yǎng)細胞的破碎
(1)確定培養(yǎng)瓶數(shù)量,使選定的各培養(yǎng)瓶細胞累加后總量達108。
(2)細胞收集:將培養(yǎng)液倒掉,用預冷的無菌PBS緩沖液洗滌一次,在培養(yǎng)瓶中加入8 ml 預冷變性液。
(3)轉動培養(yǎng)瓶,使細胞溶解,此時可見粘度加大。
(4)用無菌吸管將第一個培養(yǎng)瓶中的液體吸入第二個培養(yǎng)瓶,旋轉,溶解細胞,再吸入第三個培養(yǎng)瓶,以此類推。
(5)直到將所選定的培養(yǎng)瓶全部洗滌一次,然后從第一個培養(yǎng)瓶開始再加入4毫升上述變性液,將所有培養(yǎng)瓶洗一次。
(6)將上述12 ml 含細胞的變性液轉移至一50 ml 無菌離心管中,勻漿破碎細胞。
4. 植物組織破碎 (適用的樣品量為0.05 g 組織)
(1)將600 ul 變性液置于1.5 ml 離心管中,將此離心管放于冰浴中5分鐘。
(2)將0.05 g 新鮮組織用液氮冰凍。
(3)在液氮下,研磨組織塊。
(4)待液氮揮發(fā)后,將上述分散的組織轉移至無菌離心管中。
5. 動物組織破碎 (適用的樣品量為1 g 組織)
(1)將12 ml 變性液置于50 ml 離心管中,將此離心管放于冰浴中5分鐘。
(2)在上述管中加入1 g 新鮮或冰凍動物組織,勻漿粉碎。
二、RNA 的抽提
1. 在經(jīng)變性液勻漿的細胞或組織600 ul+60 ul pH4.0的2 M 乙酸鈉徹底混勻,可用漩渦振蕩器。
2. 600 ul 酚\氯仿\異戊醇(25\24\1),徹底混勻或漩渦振蕩器振蕩10秒。
3. 冰裕中10~15分鐘,離心,4℃,10 000 g,20分鐘。
4. 上層水相吸至無菌離心管中加等體積的異丙醇,-70℃,30分鐘沉淀RNA。
5. 離心4℃,10 000 g,20分鐘。
6. 沉淀RNA ,冷凍干燥15分鐘 , RNA 沉淀重新溶于300 ul 變性液中,可振蕩(有時為了幫助溶解,可在65℃加熱,但時間應極短)。
7. 60 ul pH4.0的2 M 乙酸鈉徹底混勻,可用漩渦振蕩器。
8. 600 ul 酚\氯仿\異戊醇(25\24\1),徹底混勻或漩渦振蕩器振蕩10秒。
9. 冰裕中10~15分鐘,離心,4℃,10 000 g,20分鐘。
10. 上層水相吸至無菌離心管中。
11. 等體積異丙醇二次沉淀(-70℃,30分鐘),75%乙醇洗沉淀,沉淀冷凍干燥。
12. 復溶于去RNA 酶的水中(對于準備長期保存的RNA 可加入pH 5.0的乙酸鈉至終濃度為0.25 M,再加入2.5體積的乙醇,-70℃保存。)。